MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 4959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013156	TAATA	2	10	1323327	1323336	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_013156	GTT	2	6	1323337	1323342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_013156	TA	3	6	1324015	1324020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_013156	AAC	2	6	1324049	1324054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_013156	ACA	2	6	1324088	1324093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_013156	ATTTT	2	10	1326114	1326123	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_013156	T	7	7	1326120	1326126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_013156	ATTTTT	2	12	1326131	1326142	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_013156	T	6	6	1326145	1326150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_013156	AT	4	8	1326796	1326803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_013156	TAA	2	6	1327640	1327645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_013156	T	6	6	1327796	1327801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_013156	AAAT	2	8	1327817	1327824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_013156	TCC	2	6	1327872	1327877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4515	NC_013156	AAC	2	6	1327909	1327914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_013156	ACG	2	6	1327915	1327920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_013156	ATT	2	6	1327930	1327935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_013156	CCA	2	6	1327962	1327967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4519	NC_013156	TTAT	2	8	1327993	1328000	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_013156	CT	3	6	1328004	1328009	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4521	NC_013156	CCA	2	6	1328020	1328025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4522	NC_013156	AAC	2	6	1328026	1328031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_013156	GAG	2	6	1328070	1328075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_013156	ATA	2	6	1328109	1328114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_013156	T	6	6	1328181	1328186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_013156	CTG	2	6	1328213	1328218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_013156	TGA	2	6	1328247	1328252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_013156	AAG	2	6	1328275	1328280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_013156	GA	3	6	1328363	1328368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_013156	AT	3	6	1328404	1328409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_013156	TAA	2	6	1328460	1328465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_013156	TGT	2	6	1328484	1328489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_013156	T	7	7	1328498	1328504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_013156	AGA	2	6	1328558	1328563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_013156	TAC	2	6	1328626	1328631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_013156	CAAAA	2	10	1328688	1328697	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4537	NC_013156	CAT	2	6	1328706	1328711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_013156	TATTT	2	10	1328712	1328721	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_013156	TAA	2	6	1328753	1328758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_013156	TGC	2	6	1328760	1328765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_013156	ATT	2	6	1328779	1328784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_013156	CCA	2	6	1328815	1328820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4543	NC_013156	GAA	2	6	1328859	1328864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_013156	CTG	2	6	1328879	1328884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_013156	ACC	2	6	1328889	1328894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4546	NC_013156	AAT	2	6	1328895	1328900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_013156	TAG	2	6	1328914	1328919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_013156	AAT	2	6	1328931	1328936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_013156	TAA	2	6	1328944	1328949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_013156	TAA	2	6	1328957	1328962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_013156	TA	3	6	1329005	1329010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_013156	CTAAAG	2	12	1329017	1329028	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4553	NC_013156	ATC	2	6	1329070	1329075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_013156	CA	3	6	1329087	1329092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4555	NC_013156	AT	3	6	1329106	1329111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_013156	A	6	6	1329118	1329123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_013156	CTC	2	6	1329125	1329130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4558	NC_013156	AT	3	6	1329164	1329169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_013156	ATT	2	6	1329283	1329288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_013156	AGT	2	6	1329307	1329312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_013156	TTA	2	6	1329313	1329318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_013156	GGAG	2	8	1329325	1329332	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_013156	T	6	6	1335841	1335846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_013156	ATTT	2	8	1335851	1335858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_013156	TAA	3	9	1335860	1335868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_013156	TA	4	8	1335889	1335896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_013156	G	6	6	1335938	1335943	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_013156	TGT	2	6	1336005	1336010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_013156	GAT	2	6	1336036	1336041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_013156	CGG	2	6	1336060	1336065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_013156	TGCC	2	8	1336104	1336111	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4572	NC_013156	ACA	2	6	1336211	1336216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_013156	ACCC	2	8	1336218	1336225	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4574	NC_013156	CAC	2	6	1336241	1336246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4575	NC_013156	T	6	6	1336249	1336254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_013156	T	6	6	1336261	1336266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_013156	AT	3	6	1336267	1336272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_013156	TGA	2	6	1336986	1336991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_013156	TTAA	2	8	1337000	1337007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_013156	A	7	7	1337081	1337087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_013156	T	7	7	1337722	1337728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_013156	TTTA	2	8	1337739	1337746	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_013156	ACCTTT	2	12	1340029	1340040	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_013156	AT	4	8	1340062	1340069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_013156	GAT	2	6	1340189	1340194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_013156	TAT	2	6	1343024	1343029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_013156	ATTTT	2	10	1343054	1343063	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_013156	TAAA	2	8	1343064	1343071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_013156	T	6	6	1343074	1343079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_013156	T	6	6	1343088	1343093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_013156	TTTA	2	8	1343107	1343114	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_013156	GGGT	2	8	1343123	1343130	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_013156	ATTA	2	8	1343156	1343163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_013156	CAA	2	6	1343221	1343226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_013156	A	6	6	1343241	1343246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_013156	ATT	2	6	1343260	1343265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_013156	T	6	6	1343264	1343269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_013156	AAG	2	6	1343298	1343303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_013156	TA	3	6	1343305	1343310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_013156	AATG	2	8	1343311	1343318	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_013156	TA	4	8	1343356	1343363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_013156	TAA	2	6	1343365	1343370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_013156	TAA	2	6	1343445	1343450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_013156	A	8	8	1343458	1343465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_013156	GTTA	2	8	1343535	1343542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_013156	GGC	2	6	1343576	1343581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_013156	CTTT	2	8	1343582	1343589	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4608	NC_013156	CAGCT	2	10	1343590	1343599	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4609	NC_013156	AAT	2	6	1343701	1343706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_013156	ATTTA	2	10	1343731	1343740	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_013156	TGA	2	6	1343764	1343769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_013156	TA	3	6	1350239	1350244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_013156	AAT	2	6	1350288	1350293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_013156	ATA	2	6	1350299	1350304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_013156	AAAT	2	8	1350314	1350321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_013156	AACAT	2	10	1350389	1350398	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4617	NC_013156	TAAAA	2	10	1350407	1350416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_013156	A	6	6	1350413	1350418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_013156	GAT	2	6	1350419	1350424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_013156	TAA	2	6	1350488	1350493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_013156	CTTA	2	8	1350499	1350506	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4622	NC_013156	GTT	2	6	1350507	1350512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_013156	CCA	2	6	1357640	1357645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4624	NC_013156	TA	4	8	1357666	1357673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_013156	AT	3	6	1357702	1357707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_013156	A	6	6	1357751	1357756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_013156	A	6	6	1357758	1357763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_013156	A	6	6	1357765	1357770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_013156	ACT	2	6	1358519	1358524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4631	NC_013156	AGA	2	6	1359566	1359571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_013156	TA	3	6	1360130	1360135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_013156	A	6	6	1360619	1360624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4905	NC_013156	ATT	2	6	1470442	1470447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4935	NC_013156	AT	3	6	1475653	1475658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4949	NC_013156	CAA	2	6	1480626	1480631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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